Estructura química

Estructura de la molécula de ácido nítrico, mostrando ángulos y enlaces.

La estructura química de una sustancia química aporta información sobre el modo en que se enlazan los diferentes átomos o iones que forman una molécula, o agregado atómico. Incluye la geometría molecular, la configuración electrónica y, en su caso, la estructura cristalina .

La geometría molecular se refiere al orden espacial de los átomos en una molécula (incluyendo distancias de enlace y ángulos de enlace) y los enlaces químicos que mantienen unidos a los átomos. La geometría molecular debe explicar la forma de las moléculas más simples como las de oxígeno o nitrógeno diatómicos, hasta las más complejas, como una molécula de proteína o de ADN. Con este término también podemos referirnos a estructuras donde no existen moléculas propiamente dichas. Los compuestos iónicos o covalentes no forman moléculas sino redes tridimensionales, enormes agregados de átomos o iones, con una estructura regular, simétrica y periódica.

Una vez conocida o supuesta la estructura química de una molécula es posible representarla mediante modelos como el modelo de barras y esferas o el modelo de espacio lleno.

MoléculaRed atómicaRed iónicaRed metálica
Thioacetic-acid-3D-balls.pngDiamond structure animation.gifCopper(I)-iodide-3D-ionic.pngNuvola di elettroni.svg
Ácido tioacético, CH3-COSHDiamante, CnYoduro de cobre (I), CuI2Metal
Enlace covalente molecularEnlace covalente reticularEnlace iónicoEnlace metálico

Geometría de moléculas covalentes

La ordenación espacial de los átomos en una determinada molécula es aquella que permite la formación de los enlaces entre dichos átomos con la menor repulsión posible entre sus nubes electrónicas, que tienden a alejarse lo más posible unas de otras. La teoría de repulsión de pares de electrones de la capa de valencia (Teoría RPECV) da una predicción aproximada de la forma o estructura de muchas moléculas simples a partir de los pares de electrones (PE) compartidos y no compartidos de cada átomo central.

La geometría molecular de un compuesto químico puede representarse de modo aproximado mediante su fórmula estructural, usando modelos 2D y 3D.

La configuración electrónica describe la distribución de los electrones de un átomo entre los distintos niveles y subniveles de energía asícomo la ocupación de los orbitales moleculares de un compuesto.

Geometría y estructura de moléculas sencillas

La teoría RPECV da una buena aproximación de la forma y estructura de muchas moléculas, que se complementa con otras aportaciones como la teoría de la hibridación o teoría de orbitales híbridos (OH).

En la tabla inferior aparecen varias moléculas sencillas, con algunas de las formas más comunes.

Molécula lineal Molécula angular Molécula plana Molécula piramidal Molécula tetraédrica
Carbonyl-sulfide-2D-dimensions.png Water-2D-labelled.png Boron-trifluoride-vibration-2D.png Thiothionylfluoride-2D-dimensions.png Silicon-tetrafluoride-2D-dimensions.png
Molécula de sulfuro de carbonilo, S=C=O Molécula de agua, H2O Molécula de trifluoruro de boro, BF3, mostrando modos de vibración Molécula de tiotionilo, S2F2 Molécula de tetrafluoruro de silicio, SiF4
Dos dobles enlaces 4 PE 3 PE 4 PE 4 PE

Obviamente, cuando aumenta el número de átomos de la molécula, aumenta la complejidad de su estructura y la dificultad de su determinación. Algunas moléculas cuyas estructuras fueron difíciles de determinar son las siguientes.

Benceno Hélices α (proteínas) ADN Hemoglobina
Benzene-3D-balls.png PDB 1vrz EBI.png DNA orbit animated.gif Hemoglobin t-r state ani.gif
Kekulé (1865) Pauling y Corey (1951) Watson y Crick (1953) Max F. Perutz (1960)

Williams O. Rodriguez (1976)

|} Wendy Nayeli J. L.